学院前身是中国人民解放军第三驱逐机学校，1949年12月1日组建于山东省济南市。同年12月24日更校名为中国人民解放军第五航空学校。1966年4月由济南迁至甘肃武威，1976年6月改名为空军第五航空学校，1986年7月更名为空军第五飞行学院。1992年8月空军第五飞行学院与空军第八飞行学院合并为空军第五飞行学院。
学院开设歼击航空兵初级指挥专业，培训层次为本科，学制四年(与长春飞行学院合计)。
歼击航空兵初级指挥专业(本科)：
本专业培养具有歼击机飞行驾驶技术，初步具备航空兵部队指挥、管理能力的初级指挥干部。
招生对象：长春飞行学院学员。
学制：四年(与长春飞行学院合计)。
毕业学员适于在空军和海军歼(强)击机航空兵部队从事飞行工作。
