2013年高考，北京中医药大学本科招生专业为中医学、中药学、针灸推拿学、中药制药、药学、公共事业(卫生事业)管理、工商管理(医药企业)、英语(医学)、法学(医药卫生)、护理学(涉外方向，男女生不限)、护理学(男女生不限);高职(专科)招生专业为护理(男女不限)，中药(中药实用技术实验班)，高职(专科)均为走读。据了解，北京中医药大学2013年高考招生录取按各省市级招生部门投档规则调阅学生电子档案，调阅比例不超过公布招生计划的120%;实行平行志愿投档的省市原则上以生源省份学校相应计划数的105%左右调档(或根据生源情况，学校与各省(市)级招办商定具体调档比例)。
高考录取时，北京中医药大学对已调档的学生，采用分数和所填报专业志愿相结合的方式安排学生专业。专业志愿分数级差为3，3，1，1分依次递减(以高考满分750分为基准)。同等条件下与专业相关科目成绩高者优先录取。对投档成绩低而又不服从专业调剂者作退档处理。对实行高考科目改革的省市，学校按学生分数和等级择优录取。据了解，北京中医药大学2013年高考的外语教学以英语为主，建议中医学(五年制除外)、管理类、英语(医学)、护理学(涉外方向)等专业以高考考试科目选择英语的学生报考;英语(医学)专业、中医学卓越针灸推拿对外交流医师培养计划专业须有英语口试成绩。
在学费方面，北京中医药大学按照有关部门批准的标准和学生所学专业学制年限收取学费，学生于每学年报到注册时交纳。中医学、中药学、中药制药、药学、针灸推拿学、英语(医学)、护理学(涉外方向)专业为5800元/年，其中中医学专业长学制前五年按照中医学本科生标准收取学费，从第六年起按照国家当年研究生相关收费政策执行;管理类、护理学、法学(医药卫生)专业为5000元/年;高职专科为7000元/年。据了解，北京中医药大学设有奖贷助学金，勤工助学指导中心，帮助和指导困难的学生开展勤工助学，发放困难补助和争取社会资助。家庭经济困难的新生可按国家有关规定申请办理国家助学贷款。
学生学习期满，成绩合格，符合学校毕业与学位授予标准，学校将颁发北京中医药大学学历证书及学位证书。
数据显示，2013年，北京市共有72736人报名参加高考。与2012年的73460人相比，今年报名总数减少700余人，报名参加高职单考单招的考生有5368人，较2012年增加257人。
