西双版纳市区到中科院植物园的距离是相对较远的，大约需要一个小时左右的车程。从市区出发，需要沿着G213国道一路向南，经过勐海县和勐腊县，再经过绿洲镇和勐养镇，最后到达中科院植物园所在的勐仑镇。

在这个过程中，车辆需要经过山路和弯道，需要特别注意安全。同时，路上也会经过一些景点，例如勐巴拉峡谷、勐仑热带植物园等，可以适当停车观光。

总的来说，西双版纳市区到中科院植物园的交通并不十分便利，但是这也为游客提供了一种探险的感觉。如果想要前往中科院植物园，最好提前做好交通规划和准备，以保证旅途的安全和顺利。